Охорону території Ужанського національного природного парку здійснює державна служба охорони, яка входить до складу служби державної охорони природно-заповідного фонду України.

Основні функції: 

- забезпечення дотримання режиму охорони територій та об’єктів природно-заповідного фонду України;

- попередження та припинення порушень природоохоронного законодавства.

Служба державної охорони, відповідно до вищезгаданих завдань, організовує і забезпечує:

• охорону природних комплексів національного природного парку;
• охорону диких тварин і місць їх перебування у межах території  парку;
• порядок використання природних ресурсів;
• дотримання вимог щодо відвідування територій та об'єктів природно-заповідного фонду;
• недопускання пошкоджень лісових насаджень унаслідок незаконних рубок;
• виконання заходів щодо запобігання виникненню, поширенню пожеж, інших надзвичайних ситуацій та їх ліквідації;
• інформування відповідних державних органів про надзвичайні ситуації;
• реалізацію заходів з профілактики та захисту природних комплексів від шкідників і хвороб у межах територій та об'єктів природно-заповідного фонду;
• підтримує у належному стані межові та охоронні знаки, інформаційні аншлаги, квартальні та ділянкові стовпи, а також протипожежні споруди;
• дотримання режиму територій та об'єктів природно-заповідного фонду, у тому числі додержання вимог проєктів організації територій та об'єктів чи проєктів утримання та реконструкції об'єктів природно-заповідного фонду на всій його території;
• проведення роз'яснювальної роботи серед населення та рекреантів парку щодо необхідності збереження особливо цінних природних комплексів та об'єктів.

Спільно з науковим відділом:

• організовує виконання службою державної охорони науково-прикладних тем;
• виконує наукову тематику розділів "Літопису природи";
• здійснює наукові дослідження з питань типологічного аналізу переважаючих типів лісу на території науково-дослідних відділень з метою відтворення корінних насаджень;
• організовує навчання для працівників служби державної охорони;
• сприяє роботі інших наукових організацій на території парку і контролює дотримання ними встановленого режиму;
• вивчає вплив та дає рекомендації щодо використання непокритих лісом площ (рілля, сінокоси, пасовища).